诊断学第七版教材-第93章
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况下,用放射性核素或非放射性核素标记的探针与细胞内的DNA或RNA进行杂交。若
探针是同位素标记,杂交后需用X光片进行放射自显影,然后观察曝光点在组织或染色体
分裂象上的相对位置。若探针用荧光标记,杂交后用荧光显微镜直接观察,现已发展了多
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色荧光技术,因此可同时检测多种DNA或RNA的情况。原位杂交由于是原位检测,因
此在对特定DNA或RNA进行检测的同时还可对其进行细胞及基因组内定位。
(二)DNA测序
DNA测序(DNA seq?aenc…ing)即DNA一级结构的测定,是现代分子生物学一项重要
的技术。由于临床上进行各种突变分析的最终目的是获得突变信息,即确定具体的突变类
型,因而不管先通过何种方法进行突变筛查,最终都会落实到DNA测序上。DNA测序能
直观地反映出DNA序列的变化,因此是诊断未知突变基因的最直接的方法,在遗传病和
肿瘤的诊断、法医学的鉴定中具有非常重要的意义。DNA序列测定常用方法有以下3种:
1.双脱氧链终止法 目前应用最多的快速测序技术是Sangei‘等1977年提出的双脱氧
链终止法(chain termination melthod)。双脱氧链终止法的基本原理是:DNA聚合酶利用
单链DNA作为模板,准确合成互补DNA链,它不仅可以以单脱氧核苷酸(dNTP)为底
物,而且可以以双脱氧核苷酸(ddNTP)为底物,ddNTP若在合成过程中3 L末端掺入了
ddNTP,DNA链的生长将会被终止,因此生成一系列不同长度的DNA片段。其基本操
作步骤‘(图4—10一1):共设4个反应管,各管中同样加入DNA模板、DNA聚合酶、放射
性核素szP标记的引物、4种dNTP,将四种不同的ddNTP(ddATP、ddTTP、dd('TP、
dd(:TP)分别加入相应管进行温育,将四管反应产物平行加到同一变性凝胶上作电泳分
离,通过放射自显影术可获得一系列全部以3,_末端ddNTP为终止碱基的长度不等的
DNA片段的电泳谱带,通过电泳谱带可直接读出DNA的核苷酸顺序。
图4—10一1 双脱氧链终止法DNA测序
2.化学降解法 化学降解法(chemical degradation seqLlencing)由Maxam&Gibert
于1977年提出,其原理是不同的碱基(G,A+G,C+T,C)可被不同的化学试剂特异
地修饰,使相应的糖苷键变得不稳定,造成碱基的特异性切割,产生四组不同长度的
DNA链的反应混合物,反应后经聚丙烯酰胺凝胶电泳和放射自显影也可读出DNA的序
列。常用的化学试剂有硫酸二甲酯和肼。化学降解反应包括碱基的修饰、将修饰的碱基从
其糖环上脱落、DNA在失去碱基的糖环处断裂。化学法的优点是模板不需体外酶促反应,
只要末段标记的DNA片段,无论单链或双链,分别标记3’端和5’端可进行双侧读取检测
短的寡核苷酸片段;其缺点是方法复杂费时,末段标记比活性低。
3.自动测序技术 自动测序技术采用自动化测序仪进行,其原理同双脱氧链终止法。
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故其作为一种有效的 扩增和检测技术具有很好的发展前毒:“。驯兀哥。w以进z甲’
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(五)单链构象多态性分析
单链构象多态性(single strand conformational polymorphism,SS(:P)分析是一种分
析突变基因的方法。其基本原理是单链DNA在非变性的情况下具有一定的空间构象,这
种构象是由于DNA内部碱基配对等分子内相互作用力来维持的,当DNA中一个碱基突
变时,其空间构象会发生改变,空间构象不同的单链DNA在非变性聚丙烯酰胺凝胶中进
行电泳时受到的阻力不同,因此通过非变性凝胶电泳可将构象不同的分子分离开,从而对
突变基因进行检测。现SS~:P多与PCR技术联用(PCR—SS(:P)检测基因突变,提高了
基因突变检测的灵敏性,现已广泛用于遗传病及肿瘤基因的分析。
(六)限制性片段长度多态性分析
限制性片段长度多态性(restriction fragment length p01ymorphism,RFLP)分析是
限制性内切酶、核酸电泳、印迹技术、探针一杂交技术的综合应用,多用于临床遗传性疾
病的基因诊断。其基本原理是限制性内切酶可特异识别DNA碱基序列并对其进行切割
(如EcoR工识别GAATTc序列并对其进行切割),当碱基发生改变时(如遗传性疾病、
肿瘤等多有基因的缺陷),造成新酶切位点的形成或旧酶切位点的消失等,从而引起限制
性内切酶酶切后的DNA片段长度差异,称限制性片段长度多态性。RFLP作为第一代遗
传标记已经广泛地应用于遗传病的连锁分析。根据这些广泛存在的遗传标记,应用定位克
隆策略已成功地确定了100多种以孟德尔遗传方式为主的遗传病基因。同时,RFLP还可
用于基因组同源性分析以及个体识别,后者在法医学中已成为常规手段和方法。
(七)单核苷酸多态性分析
单核苷酸多态性(single nucleot:ide.polymorphis,SNP)主要是指在基因组水平上由
单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,
在人群中的发生率大于1%。SNP有单碱基的转换、颠换、插入、缺失等形式,但更多的
是单个碱基的置换。现今,人们认为基因组中的这类多态性有助于解释个体间的表型差
异、不同群体和个体对疾病,特别是对复杂疾病易感性的差异,以及对各种药物的耐受性
和对环境因素反应不同。SNP作为一种遗传标记具有以下特性:
(1)密度高:它在基因组中的分布比微卫星标记广泛,可以在任何一个待研究基因的
内部或附近提供一系列标记。
(2)具有代表性:某些位于基因内部的SNP有可能直接影响蛋白质的结构或表达水
平,因此它们本身可能就是疾病遗传机制的候选改变位点,可能代表疾病遗传机理中的某
些作用因素。
(3)遗传稳定性:与微卫星等重复序列多态标记相比,SNP具有更高的遗传稳定性,
尤其是处于编码区的SNP(cSNP)。SNP一般只有2个等位基因,即是二态的,故又称双
等位基因标记(bialleic:marker…),其在任何人群中的等位基因频率都可估计出来。
(4)分析易实现自动化:由于SNP是双等位基因标记,容易进行自动化批量检测,
分析也相对简单,不需要像检测RFLP及微卫星多态标记那样进行片段长度的测量。缩短
了研究时间。目前已有多种方法可用于sNP检测,如根据DNA阵列的微测序法、动态等
位基因特异杂交、寡聚核苷酸特异连接、DNA芯片以及TaqMan系统等。不管哪一种方
法,首先必须进行靶序列的扩增,然后才能进行其他检测。
(八)基因芯片技术
基因芯片(gene chip)通常指DNA芯片,其基本原理是将大量已知的寡核苷酸分子
固定于支持物上,然后与标记的样品进行杂交,通过检测杂交信号的强弱进而判断样品中
靶分子的数量。基因芯片技术集成了探针固相原位合成技术、照相平板印刷技术、高分子
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合成技术、精密控制技术和激光共聚焦显微技术,使基因芯片具有微型化、集约化和标准
化的特点,实现了对靶基因快速、高通量的检测。
基因芯片在医学领域中具有广阔的应用前景。①在优生方面:目前知道有600多种遗
传疾病与基因有关。妇女在妊娠早期用DNA芯片做基因诊断,可以避免许多遗传疾病的
发生。②在疾病诊断方面:由于大部分疾病与基因有关,而且往往与多基因有关,因而,
利用DNA芯片可以对一些疾病进行诊断。③在器官移植、组织移植、细胞移植的基因配
型方面:如可用于HLA分型。④病原体诊断:如细菌和病毒鉴定、耐药基因的鉴定。
⑤在环境对人体的影响方面:已知花粉过敏等人体对环境的反应都与基因有关。⑥在法医
学方面:DNA芯片比早先的DNA指纹鉴定更进一步。
四、基因诊断在临床医学中的应用
(一)遗传性疾病的基因诊断
遗传性疾病往往有基因突变或存在连锁不平衡,因此可以通过基因突变检测技术或利
用DNA多态性连锁分析对遗传性疾病作出诊断。如:镰刀状红细胞贫血、血友病、地中
海贫血、脆性x综合征等均可应用分子生物学技术对其进行基因诊断。下面以a地中海贫
血(简称a地贫)为例,说明基因诊断在遗传性疾病诊断中的作用。a地贫是由于a链基
因的完全或部分缺失所致的a珠蛋白合成减少的血红蛋白病。首先可从DNA水平进行诊
断:过去是从羊水细胞中提取DNA,用标记的a珠蛋白探针通过液相杂交技术对a珠蛋
白基因缺失的程度进行检测。但液相杂交技术不够灵敏,现多采用限制性内切酶酶谱分析
技术,通过观察酶切图谱条带来进行诊断,若正常条带消失或出现异常条带,则表明由a
珠蛋白基因的改变(如缺失、突变等),从而对其进行诊断。从RNA水平进行诊断:由于
a珠蛋白基因的改变,导致a珠蛋白mRNA含量减少,因此可以应用RT—PCR的方法检
测患儿红细胞中a的珠蛋白mRNA,从而对a地贫进行诊断。
(二)感染性疾病的基因诊断
过去常采用形态学、生化学及血清学的方法对感染性疾病进行诊断,但由于痫原体侵
入人体后需潜伏一定时间后才会出现抗体或生化方面的改变,因此血清学和生化学方法很
难对其进行及时的诊断。感染性疾病确诊的方法需要从细胞、血液或分泌液中分离培养出
病原体,这些方面复杂、费时。基因诊断灵敏度高,克服了传统方法的不足,病原体侵入
机体初期就能被检测到,且可对病原体基因进行定量,从而判断该病原体是否处在复制
期,还可帮助临床医生监测治疗药物的疗效。应用分子生物学的方法不仅可以检测DNA
病毒,还可以检测RNA病毒。目前可检出的病原体有:乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、
人乳头瘤病毒、柯萨奇病毒、EB病毒、疱疹病毒、结核分枝杆菌、产毒性大肠杆菌、奈
瑟淋球菌、肺炎支原体、疟原虫、利什曼原虫、白色念珠菌等。
(三)肿瘤的基因诊断
肿瘤的形成是遗传因素与环境因素相互作用的结果,随着肿瘤分子生物学的发展,人
们对肿瘤的认识已经发展到基因水平,发现了许多肿瘤相关基因,对癌基因、原癌基因和
抑癌基因有所了解。
(1)癌基因:是指能参与或直接导致细胞发生恶性转化的基因。癌基因可分为两大
类:一类是肿瘤非特异性癌基因,如H—ras、K—ras、c—myc等基因,在肝癌、肺癌、结直
肠癌等许多肿瘤中可检测到;第二类是肿瘤特异性癌基因,如C属于非特异性癌基因;c…sis
与淋巴结肿瘤转移有关,c…abl与慢性髓性白血病有关。
(2)原癌基因:指存在于正常细胞内,在一定的因素刺激下可转变为癌基因的基因序
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列。其编码的产物可在细胞膜、细胞质、细胞核和细胞外。
(3)抑癌基因:是一类抑制细胞过度生长、增殖从而遏制肿瘤形成的基因。抑癌基因
的丢失或失活可能导致肿瘤发生。如野生型P53为抑癌基因,当其发生点突变、插入突
变、缺失突变时将会失去抑癌的作用,它的失活对于肿瘤的形成具有重要的作用。迄今为
止发现许多肿瘤中存在P53基因的突变,如肝癌、胃癌、乳腺癌、白血病和淋巴瘤等。随
着分子生物学技术的发展,我们可以应用分子生物学技术检测肿瘤相关基因,从而对癌症
进行早期诊断、对其组织学的恶性程度进行判断等。
(四)基因诊断在法医学中的应用
1983年Jeffreys等在人体基因组DNA中发现了高度可变的小卫星区域,同一个体不
同组织来源的DNA被同一酶降解后的Solnhern印迹图上的条带完全一样,而不同个体之
间(除非同卵双生)的谱带都不相同,如同人的指纹具有高度个体特异性一样,因此这种
SouIthei…n印迹图被称为DNA指纹。法医学常将此种技术用于刑事案件中的物证来源进行
鉴定和民事案件中的亲子鉴定。
第二节 流式细胞术及其临床应用
一、流式细胞术
流式细胞术(flow cytomet:ry,FcM)是一种集细胞生物化学技术、单克隆抗体技术、
激光技术、流体力学、电子技术、计算机技术、分子生物学、临床医学等理论于一体的现
代分析技术;能够对细胞或微球的物理、生理、生化、免疫、遗传、分子生物学性状及功
能状态等进行定性或定量检测,并在必要时进行分类收集的多参数检测细胞分析技术,使
用的是流式细胞仪(flow cytometry)。
二、流式细胞仪组成及其工作原理
流式细胞仪由流动室及液流驱动系统、激光光源及光束形成系统、光电检测及信息处
Ill 理系统和细胞分离纯化系统等部分组成。经染色的
激光 细胞或微球在悬液中以单行流过高强度光源的焦
\观测点 点,单个细胞在高压氧压力下流速极快,每秒可通
过5000~10 000个细胞。当细胞或微球经过焦点
时,发出一束散射光和(或)荧光,并经过滤光镜
系统收集到达一个光电检测器(光电倍增管或一个
板 固态装置),光检测器把光信号定量转化成电信号,
经数字转换器进行数字化后而成整数,然后进行电
子存储数据(图4—10一2)。数据可以调出,并以直
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三、流式细胞术的临床应用
近年来,随着流式细胞仪性能的不断改进、测定方法与技术的迅速发展、高质量试剂
的研制,使得流式细胞技术已在基础医学、临床医学及科学研究中有着广泛的应用。尤其
是流式细胞仪迅速进入临床实验室,一些检验项目已成为辅助临床疾病诊断、选择治疗方
案、预后判断等方面的重要手段。
(一)免疫学
利用FCM可进行免疫活性细胞的分型与纯化、淋巴细胞亚群与疾病关系的分析;免
疫缺陷病如艾滋病的诊断;器官移植后的免疫学监测等。
流式细胞膜免疫表型分析是流式细胞技术最主要的分析内容之一,很多细胞亚群的检
测均是以膜免疫表型为主,如T、B淋巴细胞和NK细胞分析等。
流式细胞技术可对混合细胞群体中亚群细胞进行分类检测,如淋巴细胞可依其表面标
志的不同分为T淋巴细胞(CD3’)、B淋巴细胞(CDl9。)、NK细胞(CD3一/CDl6。56’),
T淋巴细胞又可进一步分为辅助/诱导T淋巴细胞(CD3’/CD4’/CD8一)和抑制/细胞毒T
淋巴细胞(CD3’/CD4一/CD8’)等。目前淋巴亚群细胞分类多以相对百分比表达结果,但
由于百分比只能代表每种细胞在混合细胞群体中所占的比例,并不能体现在单位体积血液
中的绝对数量,而临床一些疾病的诊断需要考虑细胞的绝对数量,如艾滋病患者的血液中
辅助/诱导